腐蝕：空調系統的冷卻、冷凍水未經處理有極強的腐蝕性，如將普通鋼片或鐵釘放入水中，幾天后就會出現鐵銹，放置時間越長則銹蝕越嚴重。設備內壁常因腐蝕造成銹渣脫落，甚至于穿孔，脫落的銹渣會堵塞盤管，使制冷效果下降；同時腐蝕的存在使設備的使用壽命大為縮短。
結垢：管道內溶于水中的無機鹽結晶析出，在冷凝器等換熱面管壁上形成水垢，導致熱交換效率降低，制冷效果下降，嚴重時下降30%。同時硬垢增加，則用電量增加，嚴重時增加35%。
生物粘泥：由于水的泥土、泥沙、腐殖物形成污垢，加上細菌、藻類等微生物及其分泌物形成的生物粘泥，嚴重時造成管路堵塞；而污垢、粘泥會影響熱交換效率，多耗電能，造成高壓運行，嚴重時造成超壓停機。所有這些嚴重地影響了空調系統的正常運行。
所以中央空調系統出現水垢、銹蝕、淤泥、細菌和藻類問題將直接導致制冷能力減弱，使用壽命縮短、運行可靠性降低、能耗提高等導致運行費用增加。為使中央空調系統在最優化狀態下運行，就必須對空調系統的冷卻水和冷凍水系統進行專門的化學藥物處理：清除水垢、銹蝕、粘泥、殺菌和防腐蝕處理。